首都醫科大學附屬北京友誼醫院始建于1952年，原名為北京蘇聯紅十字醫院，是新中國成立后，由黨和政府建立的第一所大型綜合性醫院。建院初期，毛澤東、周恩來、劉少奇、朱德等老一輩革命家為醫院親筆題詞。毛澤東主席題詞“減少人民的疾病，提高人民的健康水平”。1957年3月，蘇聯政府將醫院正式移交我國政府，周恩來總理來院參加了移交儀式。1970年，周總理親自命名為“北京友誼醫院”。

因國而生，因城而長，因人而重，因時而新。經過70余年的發展，首都醫科大學附屬北京友誼醫院已發展為集醫療、教學、科研、預防為一體的北京市屬三級甲等綜合醫院，是國家消化系統疾病臨床醫學研究中心和消化健康全國重點實驗室依托單位，國家中西醫結合“旗艦”醫院試點單位，首都醫科大學第二臨床醫學院。進入新時代，醫院順應首都發展變化，立足北京“四個中心”功能定位，落實北京城市總體規劃，服務非首都功能疏解，形成了西城院區、通州院區、順義院區和城市副中心行政辦公區門診部“三區一部”新發展格局，為醫院高質量發展奠定基礎。

醫院現有職工5100余人，其中中國工程院院士1人，北京學者3人，研究生導師257人，高級專業技術人員825人，國家級和北京市級專業委員會主委、副主委及核心期刊主編、副主編95人。目前三院區編制床位3306張。2023年年門診總量336萬人次，出院患者9.4萬人次。醫院是北京市首批基本醫療保險A類定點醫療機構，已開通門診、住院異地醫保持卡結算服務，也是全國最早承擔干部保健及外賓醫療任務的醫院之一。

醫院綜合優勢明顯，專科特色突出，共有臨床醫技科室及平臺科室50個。消化和泌尿系統疾病診治，肝、腎移植，熱帶病和寄生蟲診治、中西醫結合以及臨床影像診斷和介入治療等是醫院的專業特色。

近年來，醫院的醫學科技創新能力顯著提升，學科架構日臻完善，支撐平臺不斷強化，綜合優勢進一步凸顯。醫院擁有北京市臨床醫學研究所、北京熱帶醫學研究所、北京市中西醫結合研究所、北京市臨床藥學研究所和北京市衛生局泌尿外科研究所等5個研究機構，擁有國家臨床重點專科10個，博士點27個，碩士點32個，國家住院醫師規范化培訓專業基地17個，國家專科醫師規范化培訓試點基地4個,全國重點實驗室1個，北京市重點實驗室4個，北京市臨床質控中心4個，北京市轉化中心1個，還擁有支撐臨床研究發展的國家消化系統疾病臨床醫學研究中心、消化健康全國重點實驗室、北京市首批示范研究型病房、北京臨床研究質促中心、ISO9001認證生物樣本庫、多中心互認醫學倫理平臺等。醫院與海外及國內優秀醫學院校長期保持學術交流合作，接待國內外專家學者和留學生短期交流及來院參觀見習。

2012年7月1日，北京友誼醫院作為全國和北京市醫藥衛生改革綜合試點單位，率先啟動“兩個分開、三個機制”的改革試點。2016年4月，北京友誼醫院受北京市衛計委和平谷區政府的委托管理平谷區醫院，開創“區辦市管”新模式。醫院先后于2017年4月和2019年6月啟動了醫藥分開綜合改革和醫耗聯動綜合改革，堅持“醫療改革與提升醫療技術質量相結合、與改善患者就醫感受相結合”。2023年12月，通州院區二期項目開診運行。2024年4月26日，順義院區開診，成為順義區首家三甲綜合醫院。

多年來，北京友誼醫院黨委堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，帶領全院干部職工在落實非首都功能疏解和京津冀協同發展、推進醫療改革、創新驅動發展、提升醫療質量、改善醫療服務等方面，大膽改革，銳意進取，扎實工作，整體社會評價在全市及全國醫院中名列前茅，在國家三級公立醫院績效考核中位列A+等級，在2022年度中國醫院/中國醫學院校科技量值（STEM）排名中位列全國第38位，消化內科、普通外科在全市重點專科排名中位列第一。醫院曾先后兩次被評為全國先進基層黨組織，曾獲全國扶貧攻堅先進集體、全國“三八”紅旗集體、全國模范職工之家、中國質量獎提名獎、首都勞動獎章、北京市抗擊新冠肺炎疫情先進集體、冬奧會冬殘奧會北京市先進集體等榮譽，多次被授予首都文明單位標兵等光榮稱號。2021年8月，世界著名麻風病防治專家李桓英教授被中宣部授予“時代楷模”稱號。2023年10月，中國工程院院士、中國第24批援幾內亞醫療隊隊長王振常被評為“時代楷模中國援外醫療隊群體代表”。

建院以來，北京友誼醫院得到了黨和政府以及社會各界的關懷和支持。在市委市政府、市衛生健康委和市醫院管理中心的領導下，醫院堅持“全心全意為患者服務”的宗旨，弘揚“仁愛博精”的院訓精神，建立現代醫院管理制度，堅持黨委領導下的院長負責制，以消化學科群為戰略學科，整合現有國家臨床重點專科項目、傳統特色學科、有發展潛能的優勢學科，建高原、筑高峰，全面加速學科發展。面向未來，北京友誼醫院將繼續堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，全面貫徹落實習近平總書記對北京工作的重要講話精神和對衛生工作重要指示，發揮“敢擔當，善組織，有作為，齊奮斗”的新時代友誼創業精神，立足新時代首都發展，立足健康中國建設，以創新驅動、人才強院、醫院高質量發展為發展戰略，以患者信任、職工幸福、醫院發展、黨和政府放心為發展路徑，努力建設成為醫教研防為一體的綜合型現代化醫學中心，為新時代首都發展、為人民健康做出新的更大的貢獻。

(2024年5月更新)